Шесть генов связали с выживаемостью и ответом на химиотерапию при лейкозе

Исследователи Центра геномной регуляции (CRG) в Барселоне разработали PHFScore — систему оценки прогноза при остром миелоидном лейкозе (ОМЛ), основанную на активности шести генов. Их совместный анализ позволил разделить пациентов на группы с существенно различающимися показателями выживаемости.

Отправной точкой исследования стал ген PHF19, участвующий в эпигенетической регуляции — управлении активностью других генов без изменения последовательности ДНК. Ранее команда Лусиано ди Кросе установила, что потеря PHF19 нарушает созревание клеток крови у мышей. В новой работе ученые сопоставили результаты экспериментов с данными пациентов, чтобы найти молекулярные признаки, связанные с неблагоприятным течением ОМЛ.

В итоговую панель вошли PHF19, CARMIL1, HOPX, ALDH1A1, CALR и STAR. Повышенная активность CARMIL1, HOPX и ALDH1A1 была связана с неблагоприятным прогнозом, тогда как активность CALR, STAR и PHF19 у пациентов с худшими исходами была снижена. Совместная оценка этих показателей оказалась информативнее анализа одного PHF19.

Связь PHF19 с ответом на лечение прослеживалась и в клинических данных. Среди молодых взрослых с ОМЛ пациенты с наиболее низкой активностью этого гена реже достигали ремиссии после стандартной химиотерапии: менее чем в половине случаев против показателя до 85% в группе с наиболее высокой активностью PHF19. Выживаемость в группе с низкой активностью гена также была хуже.

По мнению авторов, PHFScore может стать основой для будущих прогностических тестов. Поскольку при подозрении на ОМЛ пациентам уже проводят исследование костного мозга, измерение активности небольшой панели генов потенциально может быть проще и дешевле расширенного генетического профилирования.